Afdeling Microbiële Ecologie

Microbiële leefgemeenschappen vertegenwoordigen de grootste reservoirs van biodiversiteit op onze planeet en zijn van grote invloed op natuurlijke en door de mens gemaakte ecosystemen. Om deze enorme diversiteit te behouden en te benutten is fundamentele kennis over het functioneren van microbiële gemeenschappen en de intra- en interspecifieke interacties essentieel.

Het doel van de afdeling Microbiële Ecologie is het bestuderen van de ecologie, diversiteit, dynamiek en natuurlijke functies van micro-organismen in aquatische en terrrestrische ecosystemen. Hierbij zijn we nauw betrokken bij verscheidene NIOO-brede thema’s, in het bijzonder ‘chemical communication’, ‘microbiomes’, ‘eco-evolutionary dynamics’ en ‘disease ecology’. De belangrijkste onderzoeksactiviteiten richten zich op: 

1. de rol van micro-organismen in biogeochemische cycli, de emissie van broeikasgassen en klimaatverandering (Bodelier groep / Paul Bodelier, Riks Laanbroek)
2. de dynamiek en functioneren van micro-organismen in de bodem en rhizosfeer van planten in gematigde en tropische ecosystemen (Kuramae groep / Eiko Kuramae)
3. de chemische ecologie van micro-organismen in natuurlijke en agro- ecosystemen (Garbeva groep / Paolina Garbeva)
4. microbiële evolutie en virus-plant interactions (Zwart groep / Mark Zwart)
5. schimmel-bacterie interacties en microbiële decompositie van organisch materiaal (De Boer groep / Wietse de Boer)
6. diversiteit, assemblage & functies van microbiomen van planten en andere eukaryoten (Raaijmakers groep / Jos Raaijmakers)